More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4623 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  29.11 
 
 		 510 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  23.66 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  22.75 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  22.04 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  25.79 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  27.84 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  33.72 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  29.91 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  24.49 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 257 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>