168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0298 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  884    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  31.42 
 
 		 420 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  30.73 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 418 aa  120  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  30.67 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  33.53 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  27.2 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.74 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.64 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  24.52 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.18 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.18 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.18 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  22.78 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.18 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.18 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  24.71 
 
 		 402 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 442 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.45 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  23.87 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  31.11 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.03 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  32.58 
 
 		 496 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 439 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  36.59 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  23.67 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0271  hypothetical protein  34.85 
 
 		 126 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  31.51 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  23.19 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>