123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0105 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0105  peptidase M61 domain-containing protein  100 
 
 		 642 aa  1294    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.953091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3986  peptidase M61 domain-containing protein  53.22 
 
 		 644 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0685  peptidase M61 domain protein  52.56 
 
 		 660 aa  631  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00005  PDZ domain family protein  50.25 
 
 		 626 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2716  peptidase M61  49.92 
 
 		 693 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4782  peptidase M61 domain-containing protein  51.98 
 
 		 635 aa  608  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1128  peptidase M61 domain protein  51.38 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0290  glycyl aminopeptidase  46.77 
 
 		 650 aa  595  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4442  glycyl aminopeptidase  46.04 
 
 		 682 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2029  peptidase M61 domain protein  49.83 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1119  peptidase M61 domain-containing protein  47.05 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2252  peptidase M61 domain protein  38.58 
 
 		 623 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.205983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2163  peptidase M61 domain protein  38.85 
 
 		 623 aa  350  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1693  glycyl aminopeptidase  38.51 
 
 		 622 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.887266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  29.17 
 
 		 585 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  27.21 
 
 		 600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  26.7 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  26.73 
 
 		 587 aa  117  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  26.32 
 
 		 591 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  25.5 
 
 		 593 aa  114  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  25.68 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  24.11 
 
 		 585 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  23.86 
 
 		 600 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  23.67 
 
 		 594 aa  107  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  27.15 
 
 		 601 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  27.15 
 
 		 601 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  23.46 
 
 		 594 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  25 
 
 		 615 aa  104  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  27.27 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  22.59 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  29.37 
 
 		 571 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  25.68 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  27.49 
 
 		 585 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  24.58 
 
 		 597 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  26.8 
 
 		 578 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  25.13 
 
 		 596 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  25.58 
 
 		 584 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  28.11 
 
 		 584 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  27.22 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  22.34 
 
 		 616 aa  97.8  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  30.06 
 
 		 689 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  21.6 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  27.35 
 
 		 599 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  21.29 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  26.82 
 
 		 601 aa  94.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  21.61 
 
 		 618 aa  93.6  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  26.35 
 
 		 599 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  21.47 
 
 		 603 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  26.92 
 
 		 622 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  27.08 
 
 		 599 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  29.02 
 
 		 592 aa  91.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  24.04 
 
 		 601 aa  91.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  26.87 
 
 		 599 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  26.87 
 
 		 599 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  28.05 
 
 		 600 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  24.19 
 
 		 612 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  25.76 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  24.37 
 
 		 623 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  20.2 
 
 		 608 aa  89  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  23.29 
 
 		 605 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  23.48 
 
 		 605 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  25.77 
 
 		 596 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0385  peptidase M61 domain protein  25.32 
 
 		 506 aa  87.8  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  28.7 
 
 		 585 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  21.55 
 
 		 605 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  25.88 
 
 		 612 aa  87  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  28.54 
 
 		 590 aa  87  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  27.4 
 
 		 607 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  21.12 
 
 		 610 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  25.67 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  25.67 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  21.85 
 
 		 598 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  27.4 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  26.89 
 
 		 602 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  25.47 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  25.47 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  25.47 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  23.48 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  25.47 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  23.91 
 
 		 623 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  24.23 
 
 		 592 aa  84  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  24.13 
 
 		 621 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  25.97 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  22.61 
 
 		 600 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  22.85 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  23.39 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  24.44 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  23.4 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  24 
 
 		 588 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  23.37 
 
 		 585 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0728  peptidase M61 domain-containing protein  27.55 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.219972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  25.19 
 
 		 588 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  23.08 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  24.92 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  22.75 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  24.13 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  23.69 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  23.99 
 
 		 604 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  23.88 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  23.33 
 
 		 588 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>