294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4259 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4259  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 341 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.104554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  88.79 
 
 		 341 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1276 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 1094 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 4489 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 643 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 4079 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.91 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.91 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 3035 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 711 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 1737 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.49 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 784 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 646 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.01 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 3560 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 750 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 574 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 3172 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.55 
 
 		 1694 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  27.06 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.13 
 
 		 1979 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1676 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.86 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 3145 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.57 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 		 576 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1038 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.7 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 		 2240 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 649 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 578 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 804 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 649 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.27 
 
 		 706 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.67 
 
 		 764 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 878 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 		 643 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 649 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 565 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.47 
 
 		 560 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  28.07 
 
 		 577 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.83 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 617 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1192 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 471 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  35.04 
 
 		 1237 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 591 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 681 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.33 
 
 		 745 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00244708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.4 
 
 		 3301 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.48 
 
 		 561 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.16 
 
 		 707 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 389 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1827 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.34 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 686 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 685 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.9 
 
 		 837 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 634 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.45 
 
 		 564 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 452 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 715 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  26.85 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.86 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 662 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.37 
 
 		 581 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 		 629 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  20.63 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 828 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.11 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.26 
 
 		 561 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 714 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>