More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0657 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  296  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  90.73 
 
 
151 aa  268  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.57 
 
 
153 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  61.64 
 
 
166 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
186 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
165 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
174 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
179 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
152 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.76 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
158 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
149 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 
136 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
161 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  35.42 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  31.54 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.43 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.43 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.87 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.73 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  30.41 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.88 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.03 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.86 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.66 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.57 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.97 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.66 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.66 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.66 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.97 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.66 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.97 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.54 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.41 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>