More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3194 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.1 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.1 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.45 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.45 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.1 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.45 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  27.1 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  24.65 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 376 aa  52  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 261 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  23.04 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 242 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>