260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5425 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 272 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  48.58 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  46.69 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  46.31 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  41.74 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  38.43 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  41.23 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  34.39 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  35.75 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  36.89 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  99  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 230 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 235 aa  98.6  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 224 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  34.47 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  37.69 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  30.47 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 233 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  31.14 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.7 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>