More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1608 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  39.65 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.67 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.43 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.86 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.62 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.84 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.84 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.44 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.51 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.68 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 		 225 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.41 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.59 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.63 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  33.14 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.53 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.51 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.85 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.4 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.31 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.72 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.12 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.46 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.57 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.93 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  28.24 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.67 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2133  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  28.96 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.32 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.09 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  25 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  25 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.33 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  23.08 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  24.86 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  22.56 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  21.99 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  24.1 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  22.56 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  22.56 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  22.56 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.29 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.62 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  23.64 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2378  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  22.56 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  23.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  26.56 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  22.56 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  29.72 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.452605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>