283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.27 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.851339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.92 
 
 		 289 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.87 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.27 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  30.73 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.15 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  34.33 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  24.62 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  24.62 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  24.62 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  24.62 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  24.12 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  26.23 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.89 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  26.78 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.73 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  24.06 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.39 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  23.62 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  23.62 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.92 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  24.1 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  24.44 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  25.68 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  24.48 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  24.48 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  23.96 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  23.29 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.52 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.25 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  23.79 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.56 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0161  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.94 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  23.59 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  30.99 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>