150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0161 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0161  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1600  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.02 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  23.59 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.56 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.99 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  22.05 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  25.13 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  29.55 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  21.52 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.71 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.02 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0270  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.479827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  20.6 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4027  cyclic nucleotide-binding protein  24.77 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0447  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.98 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.4 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.15 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  23.24 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.23 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.97 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.97 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.67 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.93 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.7 
 
 
227 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.83 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.56 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.6 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.32 
 
 
352 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.66 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.54 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.51 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  25.12 
 
 
250 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  25.12 
 
 
250 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.15 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.54 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.74 
 
 
278 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  23.24 
 
 
239 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  23.47 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1987  regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases-like  23.35 
 
 
236 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.65 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1773  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.47 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.88 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  23.47 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.15 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  22.03 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.65 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.65 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.65 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.65 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.7 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.65 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3464  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.2 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0401211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.89 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.57 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  22.93 
 
 
231 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.6 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.34 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.58 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.35 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.46 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  23.71 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.54 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  23.71 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.44 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1763  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000036343  normal  0.326349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.03 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>