More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2368 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  96.1 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  88.26 
 
 
230 aa  407  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  85.28 
 
 
231 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  33.18 
 
 
230 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
230 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  32.74 
 
 
230 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
230 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  32.29 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.29 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.73 
 
 
243 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.84 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.84 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.39 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.45 
 
 
223 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  28.95 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.48 
 
 
223 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.48 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.94 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.48 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.48 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  28.71 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  25.5 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  25.5 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.5 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.5 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  24.76 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.44 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.65 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  30.05 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.33 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  23.47 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.38 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.94 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  22.97 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.56 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  23.08 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  26.67 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  19.3 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.59 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.13 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.22 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  23.96 
 
 
205 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  24.4 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  22.55 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.52 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  22.55 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  22.55 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  22.55 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  22.55 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  22.06 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  23.56 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  22.55 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  21.57 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3233  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.66 
 
 
256 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  22.06 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.29 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.29 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  22.06 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>