More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2212 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  88.26 
 
 
231 aa  407  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  85.65 
 
 
231 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  86.09 
 
 
231 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.22 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.22 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  30.77 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.77 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.77 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.19 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.86 
 
 
230 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.32 
 
 
230 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.13 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  29.65 
 
 
229 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  31.25 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.48 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.93 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.94 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.94 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  25.68 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.13 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.03 
 
 
223 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  23.3 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  23.79 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  23.79 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  23.79 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  23.79 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  30.6 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  22.07 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.56 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  22.86 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  22.86 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.72 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.39 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.25 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.44 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  22.27 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
236 aa  61.6  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.95 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  23.86 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.12 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.32 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.64 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.08 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25.14 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.84 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
352 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  21.5 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  19.69 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  24.55 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  23.47 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  21.47 
 
 
205 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.87 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.29 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  25.58 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.57 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.69 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.53 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.92 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.92 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.81 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.91 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  22.99 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.91 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  22.99 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  24.5 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>