More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0370 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  64.88 
 
 		 202 aa  288  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  65.67 
 
 		 212 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  53.23 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  49.26 
 
 		 218 aa  217  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  36.07 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.85 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.5 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  29.5 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.51 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.5 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  26.9 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  23.81 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  24.74 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.06 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  26.94 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  27.44 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.53 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  27.55 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  29.94 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  27.55 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.51 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.73 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.05 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3647  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.08 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.5 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.38 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.5 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.91 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.5 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>