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for query gene Sputcn32_2721 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  80.21 
 
 
193 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  79.69 
 
 
193 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  79.69 
 
 
193 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  79.17 
 
 
193 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  79.79 
 
 
193 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  79.27 
 
 
193 aa  314  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  79.27 
 
 
193 aa  313  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  78.76 
 
 
193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  65.1 
 
 
193 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  64.06 
 
 
193 aa  267  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  61.78 
 
 
193 aa  252  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  59.69 
 
 
235 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  61.33 
 
 
198 aa  230  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  58.55 
 
 
192 aa  228  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  52.84 
 
 
191 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  29.17 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  24.87 
 
 
195 aa  84.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  30.6 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  24.21 
 
 
192 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  27.27 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.17 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  28.42 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  22.99 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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