More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1620 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  100 
 
 		 460 aa  891    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  62.33 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  62.56 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  58.76 
 
 		 459 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  58.76 
 
 		 459 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  59.56 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  58.31 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  58.76 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  58.76 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  55.53 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  55.97 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  48.21 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  54 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  45.15 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  48.81 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  45.15 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  46.01 
 
 		 497 aa  355  6.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  43.51 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  36.93 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  30.54 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.53 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  32.07 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.04 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.54 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.14 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.53 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  28.6 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.34 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  28.1 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.9 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.91 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  27.7 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  31.11 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.01 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  27.8 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.17 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.8 
 
 		 492 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  28.86 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  27.15 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.32 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  23.84 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 479 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.72 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.47 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.67 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.34 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.34 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.34 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.03 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.34 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.34 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.34 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.08 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  24.3 
 
 		 475 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  25.73 
 
 		 471 aa  100  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 		 523 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.61 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.17 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.85 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.17 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  25.11 
 
 		 475 aa  97.1  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  24.19 
 
 		 482 aa  97.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.33 
 
 		 524 aa  96.7  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  23.5 
 
 		 463 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  25.22 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.92 
 
 		 638 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.91 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1278  Na+/solute symporter  25.99 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000360509  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  24.29 
 
 		 468 aa  93.6  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.39 
 
 		 567 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 498 aa  93.6  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.17 
 
 		 518 aa  93.2  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.95 
 
 		 482 aa  93.2  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  26.8 
 
 		 485 aa  92.8  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  26.48 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  23.83 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.66 
 
 		 517 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>