124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3749 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  50.1 
 
 		 1390 aa  1415    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  43.62 
 
 		 1419 aa  1075    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  51.5 
 
 		 1416 aa  1456    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  51.25 
 
 		 1417 aa  1452    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  49.11 
 
 		 1443 aa  1412    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  51.25 
 
 		 1417 aa  1449    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  39.34 
 
 		 1515 aa  729    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  51.17 
 
 		 1459 aa  1471    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  56.1 
 
 		 1436 aa  1631    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  49.76 
 
 		 1383 aa  1442    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  51.8 
 
 		 1441 aa  1479    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  57.12 
 
 		 1419 aa  1646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 1439 aa  2917    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  51.38 
 
 		 1446 aa  1468    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  57.38 
 
 		 1392 aa  1649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  51.24 
 
 		 1454 aa  1469    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1301 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  28.38 
 
 		 1301 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  27.82 
 
 		 1323 aa  496  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1266 aa  485  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1291 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  26.98 
 
 		 1331 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1287 aa  430  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  24.92 
 
 		 1294 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1266 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1266 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1266 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1266 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1266 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1276 aa  396  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1276 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1284 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1265 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1277 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  25.49 
 
 		 1266 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1266 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1266 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1266 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1266 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1266 aa  367  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  25.02 
 
 		 1266 aa  365  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1266 aa  364  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1266 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1291 aa  291  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1305 aa  283  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1307 aa  281  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1307 aa  279  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  20.84 
 
 		 1284 aa  239  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1307 aa  232  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1273 aa  229  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.12 
 
 		 1304 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1261 aa  224  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1273 aa  224  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 1346 aa  221  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1288 aa  218  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1267 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1309 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1271 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1271 aa  203  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  22.02 
 
 		 1273 aa  202  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1269 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1341 aa  199  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1265 aa  196  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1384 aa  194  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1276 aa  190  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1275 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1283 aa  183  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1277 aa  182  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1271 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1273 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1271 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1441 aa  174  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1379 aa  173  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  20.45 
 
 		 1378 aa  163  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1399 aa  159  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1419 aa  159  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  20.25 
 
 		 1264 aa  159  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1286 aa  157  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1399 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1274 aa  155  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1420 aa  150  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1394 aa  149  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1397 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1381 aa  147  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1398 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1398 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1397 aa  145  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1368 aa  145  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1397 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1397 aa  145  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1397 aa  145  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1372 aa  145  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  20.27 
 
 		 1472 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1397 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1399 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1399 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1306 aa  135  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1399 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  20.2 
 
 		 1426 aa  135  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1210 aa  134  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>