142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6007 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 323 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  68.28 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  64.19 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  61.94 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  61.54 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  60.97 
 
 		 335 aa  359  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  61.74 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  66.35 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  61.49 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  61.9 
 
 		 309 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  59.24 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  61.61 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  57.42 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  56.45 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  53.82 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  58.23 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  54.52 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  35.78 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  38.76 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  38.69 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  34.98 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.09 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.08 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  34.23 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 426 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  34.63 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.24 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  28.14 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  36.62 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  24.92 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.93 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.61 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.41 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.28 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  25.32 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  22.3 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  24.17 
 
 		 390 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  22.91 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  25.41 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  29.76 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  21.48 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  21.95 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  23.74 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  21.95 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  21.26 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.29 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.93 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  21.95 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  21.65 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  21.65 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  21.95 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 285 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  21.65 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>