173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0400 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0400  WD40 domain-containing protein beta Propeller  100 
 
 		 309 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  38.18 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  25.89 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.84 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  35.45 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  25.7 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  40 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.75 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.21 
 
 		 686 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  38.18 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  39.09 
 
 		 435 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.54 
 
 		 446 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.21 
 
 		 708 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 734 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.33 
 
 		 450 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.57 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.84 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.96 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.75 
 
 		 446 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.03 
 
 		 677 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  21.84 
 
 		 435 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.06 
 
 		 429 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 435 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 		 969 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  33.94 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.95 
 
 		 446 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.95 
 
 		 446 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  28.03 
 
 		 1067 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  24.52 
 
 		 432 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  24.1 
 
 		 419 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  27.13 
 
 		 419 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3362  hypothetical protein  32.8 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00117978  normal  0.0179726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.45 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.26 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  29.29 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  26.26 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  25.67 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  34.31 
 
 		 446 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  25.84 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.65 
 
 		 448 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  25.65 
 
 		 437 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.54 
 
 		 450 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  32 
 
 		 450 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  31.39 
 
 		 453 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  27.97 
 
 		 450 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  26.89 
 
 		 1069 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.23 
 
 		 1028 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.11 
 
 		 697 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.74 
 
 		 1059 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3367  hypothetical protein  32.77 
 
 		 557 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000828737  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 441 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.08 
 
 		 445 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 446 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  31.37 
 
 		 443 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.7 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  33.01 
 
 		 441 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  24.85 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  24.85 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  29.22 
 
 		 1097 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  26.61 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  24.85 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.87 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  28.78 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  31.06 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  28.79 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  30.25 
 
 		 1040 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  22.82 
 
 		 432 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.16 
 
 		 656 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.09 
 
 		 656 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  25.84 
 
 		 615 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3363  hypothetical protein  30.43 
 
 		 565 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000877827  hitchhiker  0.00789659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  26.74 
 
 		 434 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  28.77 
 
 		 439 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.4 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.3 
 
 		 701 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.22 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  26.42 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  27.86 
 
 		 774 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 431 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.88 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  26.45 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  30.25 
 
 		 1042 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3364  hypothetical protein  31.93 
 
 		 551 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00271389  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 436 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  28.34 
 
 		 1049 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 444 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 463 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.49 
 
 		 660 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.52 
 
 		 444 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>