122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1128 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2029  peptidase M61 domain protein  55.13 
 
 
632 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3986  peptidase M61 domain-containing protein  52.09 
 
 
644 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00005  PDZ domain family protein  69.14 
 
 
626 aa  885    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1128  peptidase M61 domain protein  100 
 
 
627 aa  1280    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144459  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0105  peptidase M61 domain-containing protein  51.38 
 
 
642 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.953091  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0685  peptidase M61 domain protein  52.26 
 
 
660 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2716  peptidase M61  48.51 
 
 
693 aa  565  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4442  glycyl aminopeptidase  45.84 
 
 
682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0290  glycyl aminopeptidase  45.69 
 
 
650 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4782  peptidase M61 domain-containing protein  46.29 
 
 
635 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1119  peptidase M61 domain-containing protein  46.19 
 
 
640 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2252  peptidase M61 domain protein  39.9 
 
 
623 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.205983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2163  peptidase M61 domain protein  40.03 
 
 
623 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1693  glycyl aminopeptidase  39.77 
 
 
622 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.887266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  26.17 
 
 
591 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  23.84 
 
 
587 aa  104  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  26.83 
 
 
601 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  26.83 
 
 
601 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  24.66 
 
 
600 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  26.67 
 
 
601 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  26.17 
 
 
578 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  25.13 
 
 
571 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  26.15 
 
 
597 aa  96.3  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  23.66 
 
 
624 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  24 
 
 
590 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  24.34 
 
 
594 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  23.12 
 
 
594 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  26.4 
 
 
689 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  30.07 
 
 
585 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  23.61 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  26.18 
 
 
621 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  26.3 
 
 
596 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  24.71 
 
 
641 aa  83.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  24.2 
 
 
593 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  24.2 
 
 
593 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  24.01 
 
 
616 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  24.67 
 
 
596 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  26.44 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  26.05 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  26.76 
 
 
584 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  23.25 
 
 
600 aa  80.5  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2360  peptidase M61 domain-containing protein  21.11 
 
 
617 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  24.45 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  26.67 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  25.52 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  25.16 
 
 
587 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  25.52 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  25.33 
 
 
623 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  25.52 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  25.52 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  25.52 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  25.52 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  25.69 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  25.94 
 
 
597 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  25.04 
 
 
623 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  25.05 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  23.52 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  25.25 
 
 
604 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0385  peptidase M61 domain protein  22.57 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  24.6 
 
 
600 aa  73.9  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  24.78 
 
 
599 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  25.09 
 
 
617 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  24.74 
 
 
607 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  25 
 
 
599 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1205  peptidase M61 domain protein  25.62 
 
 
606 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.440173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  24.68 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  25 
 
 
599 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  24.67 
 
 
615 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  25 
 
 
599 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  23.96 
 
 
599 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  25.86 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  23.86 
 
 
592 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  23.58 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  26.29 
 
 
600 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  25.06 
 
 
588 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  25.24 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  22.62 
 
 
601 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  25.18 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  24.71 
 
 
588 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07485  hypothetical protein  22.11 
 
 
626 aa  68.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0867062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  25 
 
 
588 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  22.97 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  23.55 
 
 
598 aa  67  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  21.92 
 
 
603 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  25.93 
 
 
602 aa  65.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  21.69 
 
 
601 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  22.35 
 
 
598 aa  64.7  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  22.94 
 
 
613 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  21.93 
 
 
603 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  25 
 
 
592 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  21.41 
 
 
528 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  20.07 
 
 
608 aa  60.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  23.61 
 
 
610 aa  60.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  23.89 
 
 
602 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  24.61 
 
 
604 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  21.76 
 
 
603 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  24.38 
 
 
594 aa  58.9  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  23.45 
 
 
603 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  26.15 
 
 
614 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  22.01 
 
 
601 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>