More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5907 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  77.88 
 
 		 113 aa  189  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  66.36 
 
 		 112 aa  160  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  53.92 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  52 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  47.27 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  41.82 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  41.82 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  45.45 
 
 		 154 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  43.27 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 123 aa  87.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40.21 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.34 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 134 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.21 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.21 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  40.2 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  39.36 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  41 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  47.73 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  47.78 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>