More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4882 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  100 
 
 		 497 aa  1033    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  52.17 
 
 		 517 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  35.11 
 
 		 513 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  33.93 
 
 		 529 aa  252  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  36.45 
 
 		 526 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  32.19 
 
 		 519 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  31.35 
 
 		 523 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  32.62 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  32.7 
 
 		 803 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  34.33 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  29.23 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  28.31 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  28.54 
 
 		 485 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.98 
 
 		 499 aa  213  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.08 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  29.22 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  29.22 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  28.54 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.77 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  28.54 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  29.47 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  30.51 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.41 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.7 
 
 		 567 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  28.27 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.95 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  27.1 
 
 		 591 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  29.27 
 
 		 603 aa  187  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.63 
 
 		 519 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  28.37 
 
 		 519 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.56 
 
 		 517 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.95 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  28.12 
 
 		 562 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.05 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  28.25 
 
 		 551 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.97 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.14 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  26.2 
 
 		 620 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.34 
 
 		 533 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.56 
 
 		 544 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  29.61 
 
 		 822 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  28.88 
 
 		 655 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  24.94 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  27.14 
 
 		 550 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  26.49 
 
 		 531 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  27.15 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.16 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  27.51 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  27.51 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  27.51 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.07 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  25.59 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  25.59 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.16 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25.21 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.57 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.23 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  25.99 
 
 		 531 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.38 
 
 		 461 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.11 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  27.78 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.34 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.79 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.18 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.45 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.39 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.67 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  25.23 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.67 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  23.24 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.44 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  25.23 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.73 
 
 		 342 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.48 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.13 
 
 		 595 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.16 
 
 		 793 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.25 
 
 		 669 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.91 
 
 		 445 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.63 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.63 
 
 		 543 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.55 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  27.98 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.07 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.36 
 
 		 442 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 481 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.38 
 
 		 551 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  26.61 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.95 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.31 
 
 		 559 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  25.23 
 
 		 330 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 539 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.67 
 
 		 681 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  28.26 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  24.23 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.1 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>