More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2868 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2868  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1444  two component transcriptional regulator, LytTR family  54.79 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5405  two component transcriptional regulator, LytTR family  50 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.379459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2091  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.42 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  normal  0.478744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2789  response regulator receiver  43.08 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2775  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.3 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5312  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.36 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.4 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1317  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.77 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.02 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12408  two-component system response regulator  41.63 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.401855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0600  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.95 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.315052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2256  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.13 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.596319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3229  LytTR family two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5824  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.85 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0489181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6102  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.7 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4908  LytTR family two component transcriptional regulator  39.53 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2661  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.13 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0804  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.89 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2439  LytTr DNA-binding region  38.13 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0307  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.15 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6060  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4001  LytTR family two component transcriptional regulator  38.13 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0800  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.6 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7151  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.63 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1836  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.5 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1475  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.24 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.059663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2354  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.26 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0758  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6406  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.14 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6676  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.63 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5335  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0837  response regulator receiver protein  52.56 
 
 		 153 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4674  LytTR family two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.124147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3726  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1209  LytTr DNA-binding region  31.27 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.32 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.37 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  29.79 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.86 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  29 
 
 		 242 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.23 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.72 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.25 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  30.65 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.46 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.01 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.23 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.42 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.64 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  29.12 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  29.71 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.69 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  29.89 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.5 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  27.24 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.32 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.3 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  27.82 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0858  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 141 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.748894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.82 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.32 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.36 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  26.78 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  30.59 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.81 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.86 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.78 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  27.59 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  27.97 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  27.61 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  26.79 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.2 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.76 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  26.55 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  26.21 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.98 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.89 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.82 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0330  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.49 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1220  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.132093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.94 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  26.48 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>