More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1201 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  100 
 
 
228 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  82.65 
 
 
220 aa  377  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0961  ABC transporter related  75.8 
 
 
220 aa  353  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000589963  normal  0.143962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0024  ABC transporter related  63.01 
 
 
221 aa  289  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0372  ABC transporter, ATPase subunit  59.82 
 
 
236 aa  262  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  50.22 
 
 
229 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
219 aa  224  9e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
225 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  51.14 
 
 
225 aa  221  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
238 aa  218  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
220 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
230 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.73 
 
 
237 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  47.95 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.03 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.03 
 
 
225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  47.93 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  45.62 
 
 
249 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  48.39 
 
 
234 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.49 
 
 
237 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  207  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.88 
 
 
242 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  46.58 
 
 
243 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
236 aa  207  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
222 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  47 
 
 
238 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
253 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45 
 
 
230 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.61 
 
 
240 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  47.93 
 
 
230 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 
228 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  46.54 
 
 
222 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
222 aa  205  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.4 
 
 
233 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  47.03 
 
 
232 aa  204  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
246 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  46.58 
 
 
253 aa  203  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  47.49 
 
 
246 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  47.49 
 
 
246 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  46.49 
 
 
240 aa  203  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  47.49 
 
 
246 aa  203  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
241 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.85 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  47.03 
 
 
263 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  47.95 
 
 
244 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
236 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.03 
 
 
225 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
226 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  48 
 
 
652 aa  201  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  45.91 
 
 
232 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.95 
 
 
233 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.91 
 
 
234 aa  201  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.91 
 
 
234 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  46.58 
 
 
246 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  45.66 
 
 
242 aa  201  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  42.47 
 
 
233 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  46.58 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  46.58 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.24 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  44.75 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  46.58 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  46.58 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.75 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  43.64 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
246 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
228 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  45.21 
 
 
240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  45.45 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  44.84 
 
 
715 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
223 aa  198  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
244 aa  198  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.08 
 
 
229 aa  198  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  45.45 
 
 
241 aa  198  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.58 
 
 
241 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  45.33 
 
 
255 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.67 
 
 
226 aa  197  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.62 
 
 
232 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  197  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  43.84 
 
 
232 aa  197  9e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 
237 aa  197  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
240 aa  197  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  46.36 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  45.21 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  46.36 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>