More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0961 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0961  ABC transporter related  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000589963  normal  0.143962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  77.27 
 
 
220 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  75.8 
 
 
228 aa  353  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0024  ABC transporter related  62.27 
 
 
221 aa  288  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0372  ABC transporter, ATPase subunit  61.19 
 
 
236 aa  265  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
225 aa  241  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  53.88 
 
 
225 aa  241  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  52.05 
 
 
229 aa  241  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
230 aa  224  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
219 aa  218  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  49.55 
 
 
233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
238 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
228 aa  208  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.45 
 
 
240 aa  208  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.86 
 
 
233 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
238 aa  207  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  47.95 
 
 
235 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.4 
 
 
234 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.4 
 
 
234 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
220 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  47.95 
 
 
224 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
236 aa  205  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  46.54 
 
 
220 aa  204  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.03 
 
 
230 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  45.45 
 
 
236 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
236 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.09 
 
 
238 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  45 
 
 
230 aa  201  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  45.91 
 
 
253 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  45.21 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  45 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  45.66 
 
 
256 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  45.21 
 
 
226 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
254 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  45.21 
 
 
226 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  45.45 
 
 
240 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  45.21 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  48.4 
 
 
234 aa  198  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
241 aa  197  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 
236 aa  198  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  45 
 
 
243 aa  197  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  45.91 
 
 
238 aa  197  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  45.66 
 
 
241 aa  197  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  45 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  45.21 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.29 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  41.94 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  45.66 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  45.45 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  45.45 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  45.45 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  46.82 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  44.55 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.25 
 
 
237 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  44.55 
 
 
247 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.58 
 
 
225 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  44.29 
 
 
251 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  44.55 
 
 
247 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  44.55 
 
 
247 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
253 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
238 aa  195  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  45.21 
 
 
242 aa  194  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.47 
 
 
293 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
253 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.38 
 
 
253 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.03 
 
 
242 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
233 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  45.66 
 
 
652 aa  193  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  42.92 
 
 
247 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  43.84 
 
 
252 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  43.64 
 
 
246 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.92 
 
 
226 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  44.75 
 
 
222 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.55 
 
 
277 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  45.66 
 
 
668 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  45.66 
 
 
668 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
222 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 
648 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 
648 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.32 
 
 
235 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  42.47 
 
 
235 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.75 
 
 
648 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.29 
 
 
266 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.92 
 
 
235 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
225 aa  192  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.58 
 
 
225 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.29 
 
 
234 aa  191  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  45.66 
 
 
232 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  46.12 
 
 
255 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 
240 aa  191  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>