174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  30.39 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 357 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  23.81 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  23.68 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  24.78 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  29.46 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.27 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  26.42 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.89 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>