202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1395 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1395  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0967319  normal  0.304519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1390  VacJ family lipoprotein  77.57 
 
 		 255 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2547  VacJ family lipoprotein  75.38 
 
 		 260 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1647  VacJ family lipoprotein  74.34 
 
 		 282 aa  410  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1311  VacJ family lipoprotein  73.86 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.451613  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1378  VacJ family lipoprotein  73.86 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1371  VacJ family lipoprotein  74.33 
 
 		 261 aa  410  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0255661  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3039  VacJ family lipoprotein  75.47 
 
 		 261 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  78.95 
 
 		 321 aa  407  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  75.85 
 
 		 261 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2897  VacJ family lipoprotein  75.09 
 
 		 261 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00503136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  73.66 
 
 		 261 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1466  VacJ family lipoprotein  75.19 
 
 		 261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2268  vacJ lipoprotein, putative  71.15 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.232246  normal  0.0547217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2807  VacJ family lipoprotein  71.15 
 
 		 259 aa  391  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1355  VacJ-like lipoprotein  68.97 
 
 		 256 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3247  VacJ-like lipoprotein  42.37 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03126  hypothetical protein  41.6 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2272  lipoprotein VacJ precursor  41.54 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00759989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  39.84 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  40.8 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1530  vacJ lipoprotein  39.26 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1636  vacJ lipoprotein  42.19 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000058509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002850  surface lipoprotein VacJ  41.74 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3382  VacJ family lipoprotein  45.27 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1437  VacJ family lipoprotein  38.67 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2602  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2826  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.853708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1336  VacJ family lipoprotein  37.84 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.134881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2885  VacJ family lipoprotein  38.61 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.231217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02272  predicted lipoprotein  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3490  lipoprotein, VacJ family  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2505  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1307  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2497  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2729  lipoprotein, VacJ family  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02233  hypothetical protein  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2642  VacJ family lipoprotein  41.36 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1311  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.561225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0386  VacJ lipoprotein  42.79 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1396  lipoprotein VacJ  42.79 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1505  VacJ family lipoprotein  42.79 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0216408  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2532  lipoprotein, VacJ family  40.91 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2581  lipoprotein VacJ family  40.91 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2635  VacJ family lipoprotein  40.91 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.0000000000141324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2621  lipoprotein, VacJ family  40.91 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2746  lipoprotein, VacJ family  40.91 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0633065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1655  VacJ lipoprotein  38.01 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000371202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  37.8 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  40.39 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  40.2 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  39.8 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  40.3 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  39.3 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  39.91 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  37.44 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  36.15 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  39.72 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.31 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  37.93 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  39.8 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  36.63 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3707  VacJ family lipoprotein  39.78 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00967458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  37.44 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  38.86 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  34.84 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  37.5 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  38.73 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  37.96 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  37.96 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  35.96 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  35.16 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  34.11 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  40.74 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  35.96 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  35.25 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  40.74 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  35.47 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  35.47 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  38.54 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  39.13 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  39.09 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0055  VacJ-like lipoprotein  35.24 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.27 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  36.5 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  35.47 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  32.3 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  38.31 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  35.05 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  36.02 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  36.19 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  38.29 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  47.06 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  34.67 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  33.62 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  35.07 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  35.07 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  35.07 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  36.11 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>