99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0808 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  47.42 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  48.08 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  45.81 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  41.53 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  28.63 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  26.43 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  27.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  30.67 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  27.02 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  24.42 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  20.81 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  25.59 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.52 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.52 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.41 
 
 		 156 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  25.63 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  28.32 
 
 		 169 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  27.11 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.92 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.74 
 
 		 140 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.65 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  25.5 
 
 		 187 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  23.55 
 
 		 449 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  30.38 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  30.32 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  30.72 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  27.07 
 
 		 146 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  28.76 
 
 		 146 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  26.7 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 146 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 142 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.2 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.56 
 
 		 142 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  25.49 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  26.06 
 
 		 341 aa  46.6  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.45 
 
 		 145 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  26.14 
 
 		 142 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.03 
 
 		 140 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  26.62 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  28.39 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  28.31 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  25.27 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.05 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  22.98 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  23.65 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.23 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  30.46 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  29.71 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  28 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  29.44 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.87 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  26.11 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  26.11 
 
 		 158 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0206  UspA domain-containing protein  20.77 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.81 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  28.05 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  25.14 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  24.84 
 
 		 180 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.99 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  28.1 
 
 		 152 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  22.22 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.1 
 
 		 147 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  28.66 
 
 		 154 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  24 
 
 		 147 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  30.13 
 
 		 147 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>