More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0499 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 364 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  71.51 
 
 		 352 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  72.09 
 
 		 352 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  71.51 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  71.51 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  70.76 
 
 		 351 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  70.47 
 
 		 351 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  70.47 
 
 		 351 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  68.86 
 
 		 351 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  67.71 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  66.67 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  73.04 
 
 		 301 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  59.42 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  43.44 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.04 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40.53 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.64 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.34 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40.24 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.24 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.65 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.77 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  41.05 
 
 		 354 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  41.46 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.27 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.92 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40.92 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.4 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  38.51 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  42.37 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  39.56 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.37 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40.81 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.69 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  38.61 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  37.15 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.65 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.22 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.94 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  40.12 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  40.94 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 		 397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  39.43 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  37.87 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  37.39 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  37.54 
 
 		 391 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  34.96 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  37.42 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.01 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 460 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  38.37 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  35.53 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  39.74 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  35.53 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.24 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>