More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3167 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 384 aa  775    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  47.31 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  46.77 
 
 		 386 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  46.51 
 
 		 402 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.04 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  46.51 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  48.91 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  48.64 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.53 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  46.3 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  45.97 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  45.97 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  45.67 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  51.05 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  43.68 
 
 		 442 aa  288  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.92 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.08 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  48.93 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  47.22 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.91 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.46 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.91 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.91 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.91 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.91 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  48.46 
 
 		 403 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  46.91 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.6 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.25 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.22 
 
 		 398 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  45.82 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  46.3 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  46.3 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.77 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  46.3 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.98 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  46.3 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  46.3 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  46.3 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  48.77 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  45.37 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.52 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  45.99 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  48.89 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  44.44 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  45.37 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  41.75 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.14 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.29 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  43.8 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.46 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  41.9 
 
 		 461 aa  263  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.25 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  44.83 
 
 		 465 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  47.27 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  42.55 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.57 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  48.67 
 
 		 379 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  49.12 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  42.42 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  41.25 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  47.97 
 
 		 385 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  45.37 
 
 		 460 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  45.98 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  41.22 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  41.22 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  42.9 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.02 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.49 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.57 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  41.42 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.88 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.74 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.53 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  41.99 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  50.74 
 
 		 359 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  41.16 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  42.38 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  46.49 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  42.89 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  41.42 
 
 		 472 aa  242  6e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  41.42 
 
 		 472 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  50.74 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  41.21 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41.12 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  40.16 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  42.33 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  43.6 
 
 		 471 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  38.68 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  42.33 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.81 
 
 		 451 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  45.68 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.95 
 
 		 458 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  45.68 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  39.82 
 
 		 458 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  46.3 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  48.91 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  45.68 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  40.92 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  46.3 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>