More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1346 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  100 
 
 		 400 aa  813    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3408  type II secretion system protein  43.32 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  43.11 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0546  type IV pilus assembly protein PilC  38.75 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0642  type II secretion system protein  39.45 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0885  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  29.7 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.66 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  27.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  27.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  27.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  27.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  27.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  27.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  27.11 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  26.87 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  26.13 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  26.68 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  26.07 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  26.07 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  26.07 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  26.38 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  26.32 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  25.63 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  26.32 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  27.34 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.11 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  29.18 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  25.81 
 
 		 405 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  25.88 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  27.41 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.71 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.75 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  27.25 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  28.89 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  26.93 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.77 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  26.76 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  29.67 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  26.12 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 403 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  28.01 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  27.18 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  28.53 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.16 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 422 aa  176  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  26.72 
 
 		 405 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  27.54 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  26.89 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  27 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  27.05 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  26.54 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  28.21 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  26.37 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  27.49 
 
 		 412 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  26.49 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  26.39 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  28.18 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  27.97 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  26.37 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  26.37 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  24.94 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  24.75 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  25.98 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  25.43 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  24.5 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  27.93 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>