More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3012 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  86.99 
 
 		 392 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  94.9 
 
 		 392 aa  747    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 392 aa  806    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  99.23 
 
 		 392 aa  800    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  92.75 
 
 		 392 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  96.63 
 
 		 392 aa  767    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  99.66 
 
 		 294 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1349  ATPase central domain-containing protein  97.98 
 
 		 99 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  30.39 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  29.45 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  26.89 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  25.45 
 
 		 497 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0341883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  30.62 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  34.33 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  32.03 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.8 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  32.4 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.83 
 
 		 621 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  32.24 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  33.33 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  30.16 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  40.44 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  32.84 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.33 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  34.75 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.51 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.82 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.69 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.78 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  34.06 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.55 
 
 		 719 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  29.35 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  32.09 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  32.59 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  29.63 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.64 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  30.46 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.61 
 
 		 616 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 		 616 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.53 
 
 		 773 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.69 
 
 		 639 aa  63.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  30.83 
 
 		 663 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.09 
 
 		 650 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  29.89 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.84 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.01 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.47 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  34.75 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  25.5 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.83 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.14 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  29.67 
 
 		 737 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.05 
 
 		 682 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.03 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  30.13 
 
 		 728 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.4 
 
 		 760 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  32.59 
 
 		 639 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.67 
 
 		 757 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.21 
 
 		 721 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 623 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  33.8 
 
 		 744 aa  62  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  33.81 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.65 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.131641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  31.47 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.31 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.09 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  29.3 
 
 		 733 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  29.85 
 
 		 703 aa  60.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  30 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.11 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.35 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.08 
 
 		 735 aa  60.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  32.84 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.78 
 
 		 742 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.12 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.84 
 
 		 636 aa  60.1  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.96 
 
 		 631 aa  60.1  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.58 
 
 		 804 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.27 
 
 		 731 aa  60.1  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  34.11 
 
 		 617 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  28.41 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  31.62 
 
 		 764 aa  60.1  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.39 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  31.39 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  31.72 
 
 		 697 aa  60.1  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  33.57 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  30 
 
 		 729 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  31.69 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.12 
 
 		 731 aa  59.7  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>