289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0396 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  566  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  34.72 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  35.34 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  32.24 
 
 		 288 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.32 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.37 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  29.9 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.18 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  29.79 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  31.16 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  28.14 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  29.79 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  29.55 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  31.1 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.45 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  28.78 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.59 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.77 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.78 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  30.07 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.12 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  29.19 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  29.37 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  32.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.38 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.4 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  29.73 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  29.67 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  27.44 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.18 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25.33 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  29.44 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.64 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.5 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.5 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  28.57 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.72 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  24.75 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  24.67 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  36.24 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  28.28 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  24.26 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  22.13 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.24 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.29 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.8 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.38 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.38 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.52 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  32.67 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.6 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.87 
 
 		 153 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  25.66 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.87 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.87 
 
 		 153 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  32.41 
 
 		 164 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.34 
 
 		 152 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  28.76 
 
 		 154 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 142 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  27.71 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  28.11 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  22.59 
 
 		 323 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  24.4 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  30.88 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  30.38 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.82 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.72 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.94 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.37 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  28.47 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.2 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  35.95 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  24.06 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  30.82 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  25.09 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  32.84 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  26 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.73 
 
 		 164 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>