More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4540 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4118  formylmethionine deformylase  90.12 
 
 		 506 aa  918    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4540  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 506 aa  1016    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129106  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  58.96 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  31.64 
 
 		 177 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  34.15 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  32.45 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  30.11 
 
 		 182 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  32.45 
 
 		 155 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33985  Peptide deformylase, organellar  33.13 
 
 		 240 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  35.33 
 
 		 179 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  33.95 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  32.9 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  32.18 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  35.92 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  32.9 
 
 		 164 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  34.21 
 
 		 164 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  35.06 
 
 		 181 aa  79  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2195  peptide deformylase  38 
 
 		 175 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.370127  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  34.85 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  32.65 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  34.81 
 
 		 154 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  34.09 
 
 		 176 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  31.13 
 
 		 159 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  30.77 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  26.19 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  31.01 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  28.81 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  31.01 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  32.31 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  32.08 
 
 		 172 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  35.47 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  39.23 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  31.21 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1409  peptide deformylase  36.71 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  36.23 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  30.06 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  29.17 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  31.06 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  30.07 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  32.98 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  41.96 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  33.11 
 
 		 150 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  31.21 
 
 		 202 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  31.87 
 
 		 202 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  34.38 
 
 		 201 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  34.33 
 
 		 147 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  36.23 
 
 		 185 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  31.21 
 
 		 187 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  29.76 
 
 		 172 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  31.21 
 
 		 187 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  31.4 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  36.21 
 
 		 168 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  32.08 
 
 		 172 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  36.11 
 
 		 169 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  36.15 
 
 		 190 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  32.67 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  30.82 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  33.58 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  31.68 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  40.71 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  33.33 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  28.21 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  35.38 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  31.68 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  30.63 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  34.09 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  34.09 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  31.68 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0898  peptide deformylase  29.05 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  30 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  29.56 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  28.66 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  39.47 
 
 		 204 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  30.26 
 
 		 170 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  36.62 
 
 		 188 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  36.36 
 
 		 173 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  34.57 
 
 		 174 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  30.57 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  29.94 
 
 		 203 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  29.76 
 
 		 201 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  29.56 
 
 		 169 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  31.94 
 
 		 211 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  32.58 
 
 		 190 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  31.68 
 
 		 168 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  27.67 
 
 		 188 aa  68.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  32.72 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  33.33 
 
 		 169 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  31.3 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  29.45 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  28.93 
 
 		 169 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  34.26 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  28.57 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  28.3 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  34.23 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  38.6 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  29.45 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  28.3 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  28.3 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  28.3 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>