More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4248 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 499 aa  944    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  88.24 
 
 		 501 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  57.7 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  52.13 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  50 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.68 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  50.49 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.81 
 
 		 483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.94 
 
 		 485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.49 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.54 
 
 		 471 aa  329  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.42 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  49.9 
 
 		 490 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  47.54 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.12 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.66 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.83 
 
 		 480 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.89 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.31 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.83 
 
 		 487 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.04 
 
 		 497 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.44 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.74 
 
 		 536 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.69 
 
 		 504 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  44.57 
 
 		 525 aa  216  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  41.17 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.47 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.76 
 
 		 529 aa  203  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  38.95 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  42.65 
 
 		 534 aa  199  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.65 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  40.71 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.43 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.83 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  39.65 
 
 		 514 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.65 
 
 		 514 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  39.96 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  36.87 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  36.56 
 
 		 506 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.01 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.86 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  31.54 
 
 		 508 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 519 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 		 514 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  37.63 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.51 
 
 		 515 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  37.76 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  37.76 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  37.76 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  37.76 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  37.76 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  37.76 
 
 		 531 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.65 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.2 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.04 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  32.49 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.69 
 
 		 523 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.5 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  34.65 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.18 
 
 		 517 aa  160  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.53 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.9 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.82 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  33.69 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.75 
 
 		 511 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.75 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 		 512 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  34.12 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.04 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.22 
 
 		 524 aa  156  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.15 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.59 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.73 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  31.79 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.59 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.32 
 
 		 499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 		 502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  36.07 
 
 		 526 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  40.08 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  34.93 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.21 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.75 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.03 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 		 531 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 		 490 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.97 
 
 		 496 aa  150  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 		 521 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.65 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.77 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.72 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.79 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  28.85 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  37.91 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>