More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1834 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  91.03 
 
 		 514 aa  791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  90.84 
 
 		 514 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 514 aa  981    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  91.62 
 
 		 514 aa  836    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  97.86 
 
 		 514 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  91.62 
 
 		 514 aa  836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  85.38 
 
 		 514 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.56 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  71.6 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  71.6 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  71.99 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  71.6 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  71.6 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  71.6 
 
 		 531 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  71.6 
 
 		 531 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  65.06 
 
 		 533 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.85 
 
 		 530 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  71.98 
 
 		 531 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  51.32 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  49.91 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.71 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  52.37 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.61 
 
 		 531 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  44.8 
 
 		 506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  43.08 
 
 		 522 aa  297  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  46.41 
 
 		 487 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.22 
 
 		 514 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.84 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  47.66 
 
 		 487 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.53 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  45.1 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  46.72 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  46.64 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.18 
 
 		 486 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.04 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.44 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.44 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.24 
 
 		 494 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.04 
 
 		 494 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  39.49 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.04 
 
 		 524 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.95 
 
 		 548 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  37.96 
 
 		 510 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  38.11 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.96 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  37.98 
 
 		 514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  39.42 
 
 		 462 aa  237  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  37.96 
 
 		 510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  38.27 
 
 		 514 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  38.27 
 
 		 514 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  36.58 
 
 		 504 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  38.27 
 
 		 514 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  37.96 
 
 		 515 aa  236  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  38.27 
 
 		 514 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  36.38 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  41.52 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  37.96 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  37.96 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  37.77 
 
 		 515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  39 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  37.96 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  36.58 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.25 
 
 		 492 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.81 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  39.5 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.85 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  37.6 
 
 		 490 aa  230  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.4 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  37.5 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  38.29 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  37.85 
 
 		 486 aa  227  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.42 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  37.13 
 
 		 499 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  41.46 
 
 		 436 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  39.43 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.83 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.82 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.22 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.62 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.6 
 
 		 490 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.58 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.09 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.96 
 
 		 488 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  36.94 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.29 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.94 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  42.16 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.24 
 
 		 496 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  34.01 
 
 		 499 aa  202  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.05 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  39.41 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  34.18 
 
 		 524 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.65 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.43 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.8 
 
 		 494 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  41.94 
 
 		 500 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>