More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1916 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  93.77 
 
 
514 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  86.35 
 
 
514 aa  744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  91.62 
 
 
514 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  980    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  90.84 
 
 
514 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
514 aa  980    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  98.64 
 
 
514 aa  971    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.98 
 
 
529 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  73.09 
 
 
531 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  73.09 
 
 
531 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  73.09 
 
 
531 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  73.49 
 
 
531 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  73.09 
 
 
531 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  73.09 
 
 
531 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  73.09 
 
 
531 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  68.44 
 
 
530 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  72.48 
 
 
531 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  63.9 
 
 
533 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  51.95 
 
 
526 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  51.87 
 
 
531 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.1 
 
 
531 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  50.97 
 
 
535 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.9 
 
 
531 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  46.35 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  43.05 
 
 
522 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.83 
 
 
514 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  45.08 
 
 
487 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.75 
 
 
513 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  48.3 
 
 
487 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.23 
 
 
517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.58 
 
 
486 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  45.53 
 
 
510 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  43.69 
 
 
523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  47.52 
 
 
482 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.59 
 
 
548 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4950  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.65 
 
 
525 aa  243  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.433467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.24 
 
 
494 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.21 
 
 
524 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.84 
 
 
494 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.8 
 
 
505 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.65 
 
 
494 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.65 
 
 
494 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.38 
 
 
492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  37.38 
 
 
510 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  37.4 
 
 
510 aa  233  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  37.65 
 
 
508 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  40.77 
 
 
502 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.8 
 
 
508 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  37.01 
 
 
510 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.01 
 
 
515 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  38.94 
 
 
492 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  37.2 
 
 
515 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  37.67 
 
 
514 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  37.06 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  37.96 
 
 
514 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  38.06 
 
 
514 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  37.2 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  37.06 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.45 
 
 
488 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  37.96 
 
 
514 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  37.96 
 
 
514 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  36.81 
 
 
515 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 
499 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  41.81 
 
 
436 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  38.81 
 
 
462 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  37.45 
 
 
486 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  36.87 
 
 
504 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  36.67 
 
 
504 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  36.31 
 
 
490 aa  223  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.97 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.84 
 
 
499 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.1 
 
 
515 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  36.67 
 
 
504 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.83 
 
 
490 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  37.48 
 
 
499 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  39.16 
 
 
503 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  37.8 
 
 
514 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  37.94 
 
 
510 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.13 
 
 
499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  39.44 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.55 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  36.86 
 
 
496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.45 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 
504 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 
488 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.06 
 
 
499 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.8 
 
 
519 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.26 
 
 
499 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 
509 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  42.55 
 
 
495 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
502 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.42 
 
 
502 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  34.02 
 
 
524 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  36.72 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  37.68 
 
 
500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  38.45 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.04 
 
 
517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  36.01 
 
 
493 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.71 
 
 
519 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.07 
 
 
496 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>