More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1513 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.74 
 
 		 669 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  50.38 
 
 		 665 aa  663    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.37 
 
 		 669 aa  685    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  73.61 
 
 		 652 aa  1006    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.37 
 
 		 669 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.21 
 
 		 669 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.21 
 
 		 669 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.06 
 
 		 669 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.21 
 
 		 669 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  53 
 
 		 670 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.21 
 
 		 669 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  51.76 
 
 		 667 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  52.53 
 
 		 680 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.21 
 
 		 669 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.98 
 
 		 670 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.76 
 
 		 669 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  51.76 
 
 		 667 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.37 
 
 		 669 aa  685    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  49.7 
 
 		 684 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.79 
 
 		 686 aa  819    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  51.48 
 
 		 668 aa  657    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  52.69 
 
 		 680 aa  635    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 648 aa  1324    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  50.23 
 
 		 684 aa  628  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  49.54 
 
 		 673 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 663 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  48.85 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 662 aa  591  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  47.09 
 
 		 659 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  47.83 
 
 		 666 aa  586  1e-166  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  46.19 
 
 		 670 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.4 
 
 		 679 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  47.52 
 
 		 666 aa  581  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  47.01 
 
 		 663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  46.77 
 
 		 672 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.9 
 
 		 676 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 674 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  45.91 
 
 		 678 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.61 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.78 
 
 		 683 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  46.44 
 
 		 688 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.86 
 
 		 672 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  46.08 
 
 		 683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  46.68 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  45.74 
 
 		 670 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 		 668 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 		 668 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  46.43 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.22 
 
 		 680 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  45.54 
 
 		 681 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.7 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  46.14 
 
 		 683 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 670 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  44.05 
 
 		 681 aa  557  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  44.59 
 
 		 690 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 670 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45.57 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  45.89 
 
 		 705 aa  554  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  43.97 
 
 		 668 aa  553  1e-156  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 		 688 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  46.68 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.41 
 
 		 677 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 		 688 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 694 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  44.72 
 
 		 685 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.21 
 
 		 711 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 681 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.48 
 
 		 680 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  42.88 
 
 		 668 aa  550  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 		 746 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  44.72 
 
 		 685 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  44.38 
 
 		 690 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.31 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.41 
 
 		 671 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  45.56 
 
 		 671 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  45.24 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.68 
 
 		 670 aa  545  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.92 
 
 		 671 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.39 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  45.41 
 
 		 671 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 681 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  44.55 
 
 		 672 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  46.29 
 
 		 674 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.17 
 
 		 706 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.41 
 
 		 671 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.56 
 
 		 671 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  45.56 
 
 		 712 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  46.9 
 
 		 671 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.41 
 
 		 671 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  44.76 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  44.38 
 
 		 690 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  45.64 
 
 		 661 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 684 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.89 
 
 		 669 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  44.38 
 
 		 691 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  43.92 
 
 		 689 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 691 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>