More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1967 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 304 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  90.03 
 
 		 307 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  59.37 
 
 		 323 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  41.45 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.38 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  28.38 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  29.37 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  28.9 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  32.72 
 
 		 356 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  30.13 
 
 		 329 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.41 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  32.88 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.07 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.01 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>