More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0285 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
990 aa  2018    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  38.48 
 
 
958 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  38.16 
 
 
937 aa  557  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  35.57 
 
 
957 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 
560 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
552 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 
551 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 
543 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  30.57 
 
 
541 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  25.73 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.12 
 
 
637 aa  147  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 
554 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 
593 aa  135  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.61 
 
 
623 aa  134  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.23 
 
 
587 aa  129  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  23.98 
 
 
624 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.21 
 
 
612 aa  127  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  29.02 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  26.82 
 
 
630 aa  121  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  30.77 
 
 
594 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  34.12 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.12 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.51 
 
 
587 aa  119  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34 
 
 
610 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.57 
 
 
638 aa  118  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.15 
 
 
596 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.37 
 
 
607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.65 
 
 
586 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40 
 
 
606 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.51 
 
 
600 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.64 
 
 
621 aa  115  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.09 
 
 
577 aa  114  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.23 
 
 
608 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.86 
 
 
629 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.86 
 
 
629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.24 
 
 
607 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.77 
 
 
630 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.4 
 
 
609 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.9 
 
 
601 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.9 
 
 
601 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.8 
 
 
601 aa  112  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 
614 aa  112  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.74 
 
 
605 aa  112  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.74 
 
 
605 aa  111  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.88 
 
 
561 aa  110  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  36.08 
 
 
592 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.41 
 
 
601 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  27.01 
 
 
625 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.04 
 
 
587 aa  110  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.84 
 
 
626 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.18 
 
 
601 aa  109  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.97 
 
 
618 aa  109  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.4 
 
 
621 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 
606 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.52 
 
 
605 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.35 
 
 
613 aa  108  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.35 
 
 
613 aa  108  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.31 
 
 
607 aa  108  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  28.19 
 
 
615 aa  107  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  35.29 
 
 
589 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  31.53 
 
 
604 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.87 
 
 
604 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.48 
 
 
642 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.71 
 
 
587 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.62 
 
 
588 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  37.57 
 
 
606 aa  106  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.07 
 
 
636 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  35.57 
 
 
687 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.03 
 
 
634 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25 
 
 
626 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 
745 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  32.03 
 
 
580 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  32.03 
 
 
580 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.34 
 
 
603 aa  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  32.03 
 
 
580 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.63 
 
 
587 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  32.03 
 
 
580 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
754 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  27.44 
 
 
708 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.9 
 
 
611 aa  104  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  30.29 
 
 
722 aa  104  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  35.29 
 
 
592 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.1 
 
 
613 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.29 
 
 
592 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  26.52 
 
 
719 aa  104  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.76 
 
 
592 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.65 
 
 
594 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.42 
 
 
672 aa  102  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.92 
 
 
610 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  24.59 
 
 
666 aa  101  5e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  30.31 
 
 
604 aa  102  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35 
 
 
594 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35 
 
 
594 aa  102  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35 
 
 
594 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.71 
 
 
577 aa  102  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30 
 
 
841 aa  102  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.76 
 
 
614 aa  101  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.81 
 
 
634 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.81 
 
 
634 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3716  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.62 
 
 
636 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0648692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>