More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2710 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  99.33 
 
 
601 aa  1225    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  100 
 
 
601 aa  1230    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  77.89 
 
 
601 aa  971    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  91.51 
 
 
601 aa  1125    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  73.51 
 
 
605 aa  881    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  72.55 
 
 
603 aa  872    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  54.53 
 
 
625 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  51.99 
 
 
592 aa  588  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  52.4 
 
 
606 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  51.19 
 
 
615 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  52.71 
 
 
604 aa  568  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  55.51 
 
 
587 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.92 
 
 
611 aa  555  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.83 
 
 
587 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.86 
 
 
588 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.83 
 
 
606 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.88 
 
 
587 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.55 
 
 
587 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  49.58 
 
 
589 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  46.88 
 
 
596 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.62 
 
 
640 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  52.27 
 
 
618 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  49.59 
 
 
640 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  52.27 
 
 
618 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.11 
 
 
636 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.33 
 
 
607 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  52.53 
 
 
598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  46.55 
 
 
586 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  51.54 
 
 
604 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  50.54 
 
 
600 aa  505  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.01 
 
 
594 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.01 
 
 
594 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.83 
 
 
594 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.83 
 
 
594 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.33 
 
 
587 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  50.09 
 
 
583 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.63 
 
 
580 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.18 
 
 
580 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3650  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.72 
 
 
580 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.736771  normal  0.277493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.47 
 
 
594 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.99 
 
 
584 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.09 
 
 
583 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  50.17 
 
 
604 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.33 
 
 
592 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  46.53 
 
 
594 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.74 
 
 
572 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.46 
 
 
580 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  52.43 
 
 
553 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  46.99 
 
 
592 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.65 
 
 
613 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.65 
 
 
613 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  46.99 
 
 
592 aa  482  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.96 
 
 
623 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.29 
 
 
601 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.73 
 
 
619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.78 
 
 
623 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.45 
 
 
607 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  49.83 
 
 
622 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.12 
 
 
623 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7030  glycoside hydrolase family protein  49.65 
 
 
623 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0292632  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.33 
 
 
601 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.27 
 
 
634 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.29 
 
 
623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.29 
 
 
623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.3 
 
 
629 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  46.39 
 
 
687 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  52.81 
 
 
580 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  52.81 
 
 
580 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  52.81 
 
 
580 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  52.81 
 
 
580 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.91 
 
 
634 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.91 
 
 
634 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.96 
 
 
638 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.94 
 
 
608 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.79 
 
 
612 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  43.68 
 
 
630 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.27 
 
 
618 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.25 
 
 
614 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.36 
 
 
605 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.55 
 
 
605 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.22 
 
 
621 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.63 
 
 
600 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.18 
 
 
621 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.23 
 
 
581 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.06 
 
 
626 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.03 
 
 
626 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3075  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.36 
 
 
583 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0126578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.07 
 
 
630 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.85 
 
 
613 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3802  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.76 
 
 
590 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300682  normal  0.0163414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3664  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.8 
 
 
659 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186742  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.34 
 
 
592 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0540  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.42 
 
 
603 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1952  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.31 
 
 
584 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.55 
 
 
629 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 
606 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.92 
 
 
642 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.55 
 
 
629 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.73 
 
 
561 aa  378  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0037  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.53 
 
 
614 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>