152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6820 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  43 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  38.43 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  38.43 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.41 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  41.8 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  41.27 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  46.21 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  33.8 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  32.05 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  35.8 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  35.1 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  37.42 
 
 		 148 aa  98.2  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.09 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  33.48 
 
 		 358 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  30.81 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  38 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  30.48 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  37.25 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.99 
 
 		 158 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  37.89 
 
 		 180 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  39.33 
 
 		 184 aa  89.4  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  37.59 
 
 		 161 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  33.33 
 
 		 167 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  40.14 
 
 		 534 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.36 
 
 		 171 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  31.05 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.52 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.76 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.28 
 
 		 388 aa  78.6  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  26.97 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  38.24 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.25 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.46 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.21 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  33.77 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  33.72 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  33.11 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  36.97 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  28.51 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  26.64 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.52 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  31.85 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 		 185 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  31.85 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.17 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.97 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  35.9 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  38.71 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  33.6 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  39.2 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  28.14 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.8 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  32.24 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.8 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  62.26 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  26.67 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.12 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  34.12 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.29 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.26 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.74 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  32.17 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  33.83 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  39.39 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.82 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  25.9 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  25.34 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.07 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.47 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  28.65 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  29.31 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  27.67 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  35.64 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  26.45 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.04 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  30.43 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  27.81 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  29.94 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.48 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.87 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.69 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  27.5 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.35 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  34.43 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  29.82 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  28.8 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  27.07 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  29.71 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5111  hypothetical protein  51.02 
 
 		 89 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0927764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>