102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6018 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  56.64 
 
 		 795 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  52.56 
 
 		 793 aa  651    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  57.14 
 
 		 795 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  53.55 
 
 		 800 aa  673    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  47.14 
 
 		 821 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  58.08 
 
 		 802 aa  759    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 800 aa  1569    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  56.39 
 
 		 795 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  47.42 
 
 		 821 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  47.31 
 
 		 820 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  46.94 
 
 		 819 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  47.54 
 
 		 821 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  46.86 
 
 		 820 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  46.81 
 
 		 821 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  43.5 
 
 		 825 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  43.79 
 
 		 815 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  43.06 
 
 		 804 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  42.56 
 
 		 819 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  44.66 
 
 		 819 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  42.31 
 
 		 819 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  42.96 
 
 		 826 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  43.12 
 
 		 820 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  28.55 
 
 		 817 aa  277  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  28.5 
 
 		 817 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.85 
 
 		 817 aa  259  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.78 
 
 		 840 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.95 
 
 		 836 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.42 
 
 		 889 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.3 
 
 		 879 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.55 
 
 		 889 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 884 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.2 
 
 		 836 aa  250  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  27.13 
 
 		 865 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.87 
 
 		 836 aa  246  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  29.72 
 
 		 849 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.8 
 
 		 897 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  28.66 
 
 		 887 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  28.1 
 
 		 887 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  28.67 
 
 		 889 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.7 
 
 		 850 aa  233  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.79 
 
 		 878 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  28.78 
 
 		 845 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.08 
 
 		 872 aa  204  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 		 803 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.1 
 
 		 849 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  29.03 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.46 
 
 		 855 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.81 
 
 		 850 aa  173  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  23.89 
 
 		 813 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 839 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 845 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 847 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.75 
 
 		 837 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.33 
 
 		 866 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 847 aa  146  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  28.42 
 
 		 843 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.8 
 
 		 870 aa  145  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  28.12 
 
 		 929 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.46 
 
 		 858 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.89 
 
 		 858 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.37 
 
 		 855 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 884 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.57 
 
 		 851 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.02 
 
 		 867 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 844 aa  77.4  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  25.44 
 
 		 857 aa  75.1  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.31 
 
 		 855 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 857 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.71 
 
 		 843 aa  70.9  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.14 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  28.12 
 
 		 853 aa  68.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 846 aa  63.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  25.14 
 
 		 868 aa  61.6  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.59 
 
 		 850 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  29.22 
 
 		 842 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  25.8 
 
 		 877 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 		 842 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 		 849 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 849 aa  54.7  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 		 842 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  21.91 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.49 
 
 		 856 aa  51.6  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.18 
 
 		 843 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 		 856 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 		 866 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  31.78 
 
 		 860 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  29.05 
 
 		 841 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  22.54 
 
 		 841 aa  47  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  29.91 
 
 		 378 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  38.78 
 
 		 882 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 408 aa  45.8  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  28.97 
 
 		 378 aa  45.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  33.77 
 
 		 407 aa  45.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  24.63 
 
 		 827 aa  45.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 376 aa  45.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  22.59 
 
 		 855 aa  44.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  24.71 
 
 		 787 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  32.35 
 
 		 413 aa  44.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>