272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5413 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 		 277 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  39.81 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 145 aa  66.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 174 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  27.1 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  29.55 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 196 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  24.74 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>