More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5178 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  96.12 
 
 		 645 aa  1299    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 645 aa  1339    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  41.73 
 
 		 651 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  41.08 
 
 		 638 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  37.85 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 642 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  35.21 
 
 		 641 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  36.8 
 
 		 638 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  36.55 
 
 		 640 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 657 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 658 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 658 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 657 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  35.01 
 
 		 664 aa  361  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 655 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 655 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.38 
 
 		 633 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 682 aa  324  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 643 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  31.92 
 
 		 686 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 		 635 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  30.97 
 
 		 765 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  31.41 
 
 		 635 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 633 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 729 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.85 
 
 		 679 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 		 735 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.33 
 
 		 626 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  34.43 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 757 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 656 aa  234  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 735 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 728 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 639 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 		 664 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 643 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 580 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 655 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 695 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 696 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 578 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 584 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 693 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 591 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 607 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 584 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  25.92 
 
 		 695 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 579 aa  127  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 579 aa  126  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 594 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 595 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 512 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 535 aa  115  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  25.93 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.85 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  25.93 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.84 
 
 		 587 aa  112  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 587 aa  110  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.64 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 534 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 577 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.06 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  25.22 
 
 		 537 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 638 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.56 
 
 		 535 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 537 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 535 aa  105  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.76 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 535 aa  104  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.76 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.76 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 627 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.9 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.32 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.17 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 539 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>