257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3364 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1106    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  92.91 
 
 		 550 aa  1044    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 572 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  41.83 
 
 		 1092 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 867 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 588 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  38.03 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 500 aa  136  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  38.14 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 930 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  37.44 
 
 		 930 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 934 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  36.04 
 
 		 1045 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 759 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  39.49 
 
 		 480 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 		 733 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  24.03 
 
 		 561 aa  127  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 		 1027 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  38.38 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 512 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  36.18 
 
 		 1160 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 850 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  35.71 
 
 		 334 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 352 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.65 
 
 		 842 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 481 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.86 
 
 		 1190 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  34.74 
 
 		 1170 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 505 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 338 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  34.74 
 
 		 1170 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 503 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 586 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 713 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 		 1165 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.78 
 
 		 849 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 677 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  35.5 
 
 		 332 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  36.95 
 
 		 313 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.08 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 728 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  35.47 
 
 		 333 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  38.19 
 
 		 872 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  33.61 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1191 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 929 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.53 
 
 		 1063 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 1061 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 907 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 304 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 840 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 583 aa  114  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 856 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 		 855 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.61 
 
 		 717 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 713 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.68 
 
 		 1167 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  35.75 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  34.9 
 
 		 234 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  31.55 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 632 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.53 
 
 		 846 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 491 aa  110  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 336 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 234 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>