205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4905 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  59.63 
 
 		 877 aa  921    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  58.46 
 
 		 1079 aa  885    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  49.65 
 
 		 887 aa  757    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  58.46 
 
 		 969 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  58.46 
 
 		 877 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  59.26 
 
 		 877 aa  942    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  59.61 
 
 		 877 aa  896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  49.83 
 
 		 868 aa  736    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  50.17 
 
 		 862 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.86 
 
 		 882 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  58.17 
 
 		 871 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.57 
 
 		 882 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  49.94 
 
 		 868 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  49.42 
 
 		 872 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  70.8 
 
 		 908 aa  1165    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  59.15 
 
 		 877 aa  919    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.85 
 
 		 882 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  47.18 
 
 		 887 aa  713    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.31 
 
 		 882 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  59.15 
 
 		 877 aa  916    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.22 
 
 		 882 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  59.15 
 
 		 877 aa  919    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  59.52 
 
 		 870 aa  954    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  58.46 
 
 		 1083 aa  885    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  58.46 
 
 		 877 aa  886    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  58.57 
 
 		 877 aa  887    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  58.46 
 
 		 877 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  58.46 
 
 		 877 aa  886    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.79 
 
 		 868 aa  769    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  49.71 
 
 		 862 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  57.94 
 
 		 871 aa  934    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  59.26 
 
 		 877 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  43.6 
 
 		 895 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  46.8 
 
 		 669 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  39.68 
 
 		 864 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  40.34 
 
 		 864 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  37.2 
 
 		 889 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  33.45 
 
 		 901 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.88 
 
 		 900 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  35.89 
 
 		 879 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  37.68 
 
 		 858 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  32.88 
 
 		 890 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  33.86 
 
 		 901 aa  352  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  31.37 
 
 		 884 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  29.99 
 
 		 767 aa  268  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  26.73 
 
 		 1128 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  27.35 
 
 		 920 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.14 
 
 		 886 aa  257  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  26.55 
 
 		 892 aa  252  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.29 
 
 		 883 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.41 
 
 		 883 aa  243  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.52 
 
 		 899 aa  224  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.65 
 
 		 910 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.29 
 
 		 893 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.87 
 
 		 972 aa  194  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  26.01 
 
 		 906 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.74 
 
 		 1045 aa  135  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  25.5 
 
 		 845 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  25.31 
 
 		 846 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.31 
 
 		 840 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  25.31 
 
 		 840 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  18.14 
 
 		 798 aa  67.8  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  31.53 
 
 		 805 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  27.03 
 
 		 1013 aa  63.9  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  31.16 
 
 		 1287 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  21.16 
 
 		 380 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  19.87 
 
 		 1274 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.47 
 
 		 762 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  37.37 
 
 		 782 aa  62  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  24.13 
 
 		 840 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  18.94 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  29.68 
 
 		 839 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.4 
 
 		 1226 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.5 
 
 		 1172 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  27.21 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  29.9 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  19.97 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  27.59 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  31.3 
 
 		 1359 aa  58.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  24.48 
 
 		 813 aa  58.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  23.86 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  24.03 
 
 		 843 aa  58.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  27.75 
 
 		 1040 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  28.34 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  24.03 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  30.63 
 
 		 855 aa  57.4  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.78 
 
 		 747 aa  57.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  27.75 
 
 		 1028 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  23.84 
 
 		 845 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  26.49 
 
 		 702 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  28.51 
 
 		 967 aa  57  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  32.8 
 
 		 699 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  29.75 
 
 		 1003 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  26.75 
 
 		 800 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.12 
 
 		 388 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  28.65 
 
 		 358 aa  55.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  32.2 
 
 		 847 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  25.55 
 
 		 748 aa  55.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  27.27 
 
 		 755 aa  54.7  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>