164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4779 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  46.38 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  44.93 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  45.19 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  40.17 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  40.17 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 225 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  31.65 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28.26 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  32.81 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  32.81 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.23 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  29.5 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  30.23 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  26.85 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  32.31 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  29.85 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  29.03 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  33.06 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  33.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  33.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  33.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  33.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  33.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  32.22 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  32.23 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  26.62 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  35.96 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  27.66 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  34.52 
 
 		 319 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  27.34 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  28.67 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  28.67 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 232 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  29.06 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  38.27 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  34.88 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  33.78 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>