More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4418 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4418  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5247  LysR family transcriptional regulator  62.54 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0614606  normal  0.32448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3031  LysR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0317613  normal  0.872582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2020  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257834  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2501  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4635  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1220  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 314 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 314 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  25.37 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 417 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3983  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3964  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0923381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0434  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 294 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  27.31 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 434 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.21 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4033  putative LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.96 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>