101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1541 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  52.58 
 
 		 820 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 795 aa  1504    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  56.29 
 
 		 793 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  52.52 
 
 		 821 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  52.52 
 
 		 821 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  52.64 
 
 		 819 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  98.74 
 
 		 795 aa  1484    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  91.45 
 
 		 795 aa  1178    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  62.25 
 
 		 800 aa  751    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  52.69 
 
 		 821 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  61.1 
 
 		 802 aa  773    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  56.71 
 
 		 800 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  51.66 
 
 		 821 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  51.47 
 
 		 820 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  48.84 
 
 		 825 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  48.22 
 
 		 815 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  48.33 
 
 		 819 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  48.96 
 
 		 826 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  48.08 
 
 		 819 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  49.45 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  47.72 
 
 		 820 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  46.48 
 
 		 804 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.3 
 
 		 817 aa  318  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  30.8 
 
 		 817 aa  291  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.94 
 
 		 817 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.78 
 
 		 836 aa  273  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.5 
 
 		 836 aa  253  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.08 
 
 		 836 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.25 
 
 		 889 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  27.82 
 
 		 879 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.27 
 
 		 884 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.06 
 
 		 889 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.21 
 
 		 897 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  28.67 
 
 		 840 aa  237  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  29.07 
 
 		 887 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  27.13 
 
 		 865 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  28.3 
 
 		 889 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 803 aa  222  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.05 
 
 		 850 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  28.4 
 
 		 845 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.8 
 
 		 878 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  28.61 
 
 		 849 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.18 
 
 		 887 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  30.25 
 
 		 850 aa  211  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  28.3 
 
 		 855 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.94 
 
 		 849 aa  190  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 837 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 		 847 aa  185  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 839 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  30.45 
 
 		 753 aa  183  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  29.43 
 
 		 866 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  29.16 
 
 		 870 aa  173  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 		 845 aa  171  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 		 847 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  30.03 
 
 		 872 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  24.55 
 
 		 813 aa  161  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.61 
 
 		 843 aa  160  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.79 
 
 		 929 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.14 
 
 		 858 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 846 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 843 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.44 
 
 		 858 aa  107  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  28.17 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.35 
 
 		 855 aa  104  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.67 
 
 		 846 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.08 
 
 		 867 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 844 aa  98.2  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 857 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.18 
 
 		 851 aa  94.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  27.97 
 
 		 855 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 884 aa  90.9  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.97 
 
 		 868 aa  88.2  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  26.7 
 
 		 853 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.41 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  37.72 
 
 		 842 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  37.72 
 
 		 842 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  30.72 
 
 		 877 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  37.72 
 
 		 842 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  29.63 
 
 		 866 aa  72  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  36.6 
 
 		 841 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 856 aa  57.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.7 
 
 		 843 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 		 849 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 849 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  25.04 
 
 		 851 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 		 866 aa  52.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.96 
 
 		 411 aa  48.1  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 445 aa  48.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 856 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.94 
 
 		 874 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  29.2 
 
 		 393 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  23.49 
 
 		 855 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  29.32 
 
 		 827 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.66 
 
 		 424 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.95 
 
 		 410 aa  45.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.14 
 
 		 416 aa  45.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  23.67 
 
 		 831 aa  44.3  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>