173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4586 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  100 
 
 		 328 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  35.28 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  34.17 
 
 		 316 aa  222  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  37.29 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  34.88 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  32.81 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  33.02 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  29.41 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  28.61 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  27.36 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  22.96 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25.84 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  23.72 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.14 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.37 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.56 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  21.88 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  21.88 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  21.92 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  20.85 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.8 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  22.84 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  22.01 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  22.01 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.01 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  22.05 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.16 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  21.77 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.64 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  23.62 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  22.46 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  23.29 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  21.45 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  24.05 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  22.88 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.37 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.21 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  25.86 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.58 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  22.47 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  21.45 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  21.68 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  23.9 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  22.47 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  23.12 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  22.47 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  25.64 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  21.33 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  22.48 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  24.27 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  21.2 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  24.69 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  23.24 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  22.26 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  20.98 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  21.22 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  25.44 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  23.28 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  22.43 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  28.22 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  26.36 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  25.44 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  22.86 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  21.73 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  21.7 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  24.06 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>